中央支農(nóng)專項資金種類多、規(guī)模大、涉及面廣、資金鏈條長，這些都給管理工作帶來了很多困難。審計署駐蘭州特派辦近期對甘肅省中央支農(nóng)專項資金進行了審計調(diào)查，調(diào)查結(jié)果顯示，甘肅省各市（州）、各部門在加強中央支農(nóng)專項資金管理，提高資金使用效益等方面積極采取措施，做了大量工作，管理工作逐步加強，擠占挪用等違規(guī)問題明顯少于前幾年。

    一是各級政府和有關(guān)部門高度重視支農(nóng)資金的管理，加強領(lǐng)導(dǎo)，建立責任制，加強項目資金申報工作，如：小麥良種補貼、農(nóng)機具購置等9項補貼，及時下發(fā)了申報立項指南，按照自下而上、逐級上報的程序認真篩選，上報項目。對上報中央的項目嚴格實行了項目申報標準文本和專家評審制度。

    二是加強建章立制工作，做到制度健全。甘肅省財政廳及有關(guān)部門制定下發(fā)了《甘肅省農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)化專項資金項目管理辦法》、《甘肅省財政扶貧資金報賬制管理辦法》等9項資金管理辦法，有效地促進了各項資金管理的制度化、規(guī)范化。

    三是積極探索支農(nóng)專項資金的整合，努力發(fā)揮資金的整體合力。2006年，全省開展了支農(nóng)專項資金整合試點工作，各地區(qū)根據(jù)當?shù)氐臈l件和特點，采取不同方式，以縣為主推進支農(nóng)專項資金整合，以縣域經(jīng)濟的發(fā)展目標確定支農(nóng)專項資金的重點投向，并修訂完善了各項管理制度。如：定西市安定區(qū)堅持從實際出發(fā)，在全區(qū)農(nóng)業(yè)和農(nóng)村總體發(fā)展、優(yōu)勢產(chǎn)業(yè)和重點區(qū)域開發(fā)、新農(nóng)村建設(shè)等方面，整合支農(nóng)資金。

    四是加大了支農(nóng)資金監(jiān)督檢查力度。甘肅省下發(fā)了《關(guān)于開展財政農(nóng)業(yè)專項資金專項檢查的通知》，對89個農(nóng)業(yè)專項資金進行了重點抽查，針對查出的問題，制定了實施方案，完善了管理辦法，規(guī)范了工作程序，提高了資金使用的安全性和有效性。